Trước lễ khai mạc SEA Games đúng một ngày, sáng 11/5, 11 Quốc kỳ của 11 Quốc gia Đông Nam Á tham dự ngày hội thể thao lớn nhất khu vực đã được kéo lên tại khu vực khán đài B của Sân vận động quốc gia Mỹ Đình trong lễ thượng cờ SEA Games 31. Lễ thượng cờ được tổ chức nhằm mục đích thể hiện sự có mặt của các quốc gia, chào đón các đoàn thể thao đến tham dự SEA Games 31, khích lệ tinh thần thi đấu của các vận động viên. Sự kiện cũng góp phần thể hiện bản sắc, văn hóa và con người Việt Nam, mang đến trải nghiệm đáng nhớ cho các vận động viên tham dự Đại hội.