Tám câu lạc bộ tham gia giải đấu lần này gồm: V&V United, Ninh Bình, Cường Quốc, SH Bank, Anh em, Chery SC, Đông Nam Á, Bình Minh. Hình thức thi đấu bóng đá 11 người với phương thức thi đấu áp dụng cho giải bóng đá V&V League Cup MV 2009 cụ thể như sau: 8 đội thi đấu vòng tròn 2 lượt sân nhà và sân đối phương tính bảng xếp hạng, 2 đội nhất và nhì toàn giải đá 1 trận tranh Siêu cúp.
Hai đội nhất, nhì toàn giải sẽ đá trận tranh siêu Cup vào ngày 30/8 trên SVĐ Hàng Đẫy. Phần thưởng của đội vô địch là 20 triệu đồng, hạng nhì 15 triệu đồng, hạng ba 10 triệu đồng. Ngoài ra, BTC còn dành riêng 6 triệu đồng tiền thưởng cho đội thắng ở trận siêu cúp, giải phong cách, Cầu thủ ghi nhiều bàn thắng và Thủ môn xuất sắc nhất giải.