Giải thưởng Trường học Sinh thái ASEAN lần thứ nhất được tổ chức tại Malaysia vào tháng 7/2012, lần thứ hai tại Myanmar vào tháng 7/2015. Giải thưởng Trường học Sinh thái ASEAN lần 3 và Giải thưởng Nhà vô địch Sinh thái trẻ ASEAN lần thứ nhất được tổ chức năm 2019 tại Campuchia.
Từ năm 2019, hai giải thưởng được trao 4 năm/lần, trở thành hoạt động cố định của Nhóm Công tác ASEAN về giáo dục môi trường (AWGEE).
Đến nay, đã có 8 trường học tại Việt Nam được vinh danh Trường học Sinh thái ASEAN; 4 người Việt Nam được vinh danh Nhà vô địch Sinh thái trẻ ASEAN.